Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG3Q96JB2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COG3Q96JB2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COG3Q96JB2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COG3Q96JB2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COG3Q96JB2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
COG3Q96JB2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COG3Q96JB2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms