Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms