Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC11Q96J66 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC11Q96J66 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms