Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms