Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms