Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms