Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXNL1Q96CM4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXNL1Q96CM4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms