Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CCDC74AQ96AQ1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CCDC74AQ96AQ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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CCDC74AQ96AQ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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CCDC74AQ96AQ1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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CCDC74AQ96AQ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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CCDC74AQ96AQ1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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