Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF34Q969K3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms