Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP13Q92995 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP13Q92995 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP13Q92995 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP13Q92995 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP13Q92995 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP13Q92995 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP13Q92995 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP13Q92995 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP13Q92995 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP13Q92995 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP13Q92995 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP13Q92995 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP13Q92995 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP13Q92995 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms