Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms