Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms