Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCSTNQ92542 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCSTNQ92542 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms