Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF62

ATP8B4, Probable phospholipid-transporting ATPase IM, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B4Q8TF62 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP8B4Q8TF62 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B4Q8TF62 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms