Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45GIP1Q8TAE8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms