Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms