Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms