Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGBL3Q8NEM8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGBL3Q8NEM8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGBL3Q8NEM8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGBL3Q8NEM8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGBL3Q8NEM8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGBL3Q8NEM8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGBL3Q8NEM8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGBL3Q8NEM8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms