Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM3Q8NE01 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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