Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDPRQ8NCN5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDPRQ8NCN5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms