Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms