Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VWDEQ8N2E2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VWDEQ8N2E2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VWDEQ8N2E2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VWDEQ8N2E2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
VWDEQ8N2E2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms