Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC117Q8IWD4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms