Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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RAB11FIP4Q86YS3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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RAB11FIP4Q86YS3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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RAB11FIP4Q86YS3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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RAB11FIP4Q86YS3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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RAB11FIP4Q86YS3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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RAB11FIP4Q86YS3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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RAB11FIP4Q86YS3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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