Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms