Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms