Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SV2AQ7L0J3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms