Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms