Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms