Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms