Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms