Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms