Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf54Q6X4T0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms