Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNT2Q6UVM3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNT2Q6UVM3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms