Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZCCHC12Q6PEW1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZCCHC12Q6PEW1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms