Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CSAG1Q6PB30 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms