Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms