Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms