Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms