Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms