Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms