Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LRRC38Q5VT99 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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LRRC38Q5VT99 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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LRRC38Q5VT99 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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LRRC38Q5VT99 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms