Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC122Q5T0U0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms