Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PIK3CD-AS1Q5SR53 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PIK3CD-AS1Q5SR53 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms