Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNT1Q5JUK3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms