Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms