Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms