Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRDTQ58F21 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms