Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LACTB2Q53H82 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LACTB2Q53H82 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms