Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CRY2Q49AN0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms